3种榕属叶绿体基因组密码子偏好性分析

编号 zgly0001743729

文献类型 期刊论文

文献题名 3种榕属叶绿体基因组密码子偏好性分析

作者 夏晞  彭劲谕  王大玮  张新洛  李江飞 

作者单位 西南林业大学 

母体文献 西北林学院学报 

年卷期 2022,37(5)

页码 88-94

年份 2022 

分类号 S796 

关键词 黄葛榕  榕树  异叶榕  叶绿体基因组  最优密码子 

文摘内容 为更好了解黄葛榕、榕树和异叶榕叶绿体基因组密码子的使用模式,利用Codon W、CUSP、EXCEL等软件对其叶绿体编码基因的密码子使用偏好性进行系统分析。结果表明,3种榕属植物的第3位碱基以A/T为主且GC3的含量远低于GC1和GC2;并且大部分的ENC值都在40以上,说明3种榕属植物的密码子偏好性较弱;中性绘图、ENC-plot和PR2-plot绘图分析表明,3种榕属植物的密码子偏好性不仅受选择的影响,还受突变等多重因素的影响;此外,还确定了3种榕属植物的最优密码子,且都以A/U结尾。该研究结果可为榕属植物叶绿体基因组后续的外源基因改良奠定基础。