黑柄炭角菌的单核苷酸多态性研究(英文)

编号 zgly0001411488

文献类型 期刊论文

文献题名 黑柄炭角菌的单核苷酸多态性研究(英文)

作者 马橙  陈作红  张平 

作者单位 湖南师范大学生命科学学院应用真菌研究室 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2011年03期

年份 2011 

分类号 Q933 

关键词 黑柄炭角菌  分子标记  单倍型  异核体 

文摘内容 以SNPs作为分子标记,对黑柄炭角菌的生活史和遗传多样性进行研究。基于黑柄炭角菌的基因组文库,在两个菌株(X-WC和X-LY)的34个片段(19,680bp)中共发现193个SNPs,SNP发生率为0.981%。193个SNPs位点都有两个可变的核苷酸,其中132个转换,61个颠换,转换与颠换比率为2.16。此外,对两个菌株序列进行比较,发现了41个插入/缺失位点。从34个片段中选择4个片段,分别比较菌株内的SNPs情况。X-WC的菌株内SNP发生率为每个核苷酸1.308%(30/2293),X-LY的菌株内SNP发生率为每个核苷酸1.352%(31/2293)。序列图谱中有31个重叠峰,表明菌株X-LY的菌核是异核体。