基于ITS序列的灵芝遗传多样性与群体遗传分化研究

编号 zgly0001634787

文献类型 期刊论文

文献题名 基于ITS序列的灵芝遗传多样性与群体遗传分化研究

作者 刘雪莹  韩玉立  司静  李春道  崔宝凯 

作者单位 北京林业大学微生物研究所  临沂市生产力促进中心 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2018年05期

年份 2018 

分类号 S567.31 

关键词 ITS序列  分子标记  单倍型  基因流  药用菌 

文摘内容 本研究基于ITS序列对中国8个不同地理群体的168份灵芝样本的分子变异、遗传多样性、群体遗传分化程度进行了分析。结果表明:168个样品中共检测到39个单倍型(H1-H39),表现出较低的遗传多样性水平(Hd=0.867±0.018,Pi=0.00304±0.00024),各群体的遗传多样性水平相差不大;TCS单倍型网络图和基于ML、NJ法构建的单倍型系统发育树显示,各地理群体的遗传距离与地理距离之间没有形成对应关系,二者没有明显的相关性;AMOVA分析结果显示不同地理群体间的遗传变异占4.33%,群体内的变异占95.67%,遗传分化主要来自于群体内部。总体和各地理群体的中性检验结果显示,群体扩张遵循中性进化,群体大小保持相对稳定。整体的遗传分化指数Fst为0.04331,基因流Nm为2.99,表明各地理群体间存在频繁的基因交流,群体遗传分化较小。推测原因可能为种群扩张历史较短,分布范围较窄,造成遗传多样性偏低,各群体间遗传分化不大。