蝴蝶兰EST资源SSR标记分析与开发

编号 zgly0001420161

文献类型 期刊论文

文献题名 蝴蝶兰EST资源SSR标记分析与开发

作者 张水明  陈程  龚凌燕  汪天 

作者单位 安徽农业大学园艺学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2012年06期

年份 2012 

分类号 S682.31 

关键词 蝴蝶兰  EST-SSR  分子标记 

文摘内容 利用SSRIT软件对NCBI上蝴蝶兰的8 188条EST序列按照碱基重复单元数8以上的标准进行SSR位点查找,发掘出246条EST序列,共含有261个SSR位点,检出率为3.19%。二核苷酸重复是最主要的重复类型,占SSR总数的94.25%。SSR的不同重复单元中,最常见的重复单元是:(TA)n和(GA)n,其余出现频率较高的依次为(TC)n、(AT)n和(AG)n。设计了32对EST-SSR引物,以蝴蝶兰品种‘V31’的DNA为模板进行PCR扩增,发现16对引物能扩增出预期产物。进一步用这16对引物对16个蝴蝶兰品种(系)进行PCR扩增,9对引物有多态性,多态性条带数在2~12个之间。结果表明,设计开发的蝴蝶兰的EST-SSR标记是有效的。