基于EST-SSR标记的陕西茶树种质资源遗传多样性研究

编号 zgly0001733336

文献类型 期刊论文

文献题名 基于EST-SSR标记的陕西茶树种质资源遗传多样性研究

作者 班秋艳  潘宇婷  潘铖  胡欣  李叶云  江昌俊 

作者单位 安徽农业大学茶与食品科技学院  河南农业大学园艺学院  陕西苍山秦茶集团有限公司 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2021,(11)

页码 1-10

年份 2021 

分类号 S571.1 

关键词 茶树育种  分子标记  EST-SSR  遗传多样性  陕西省 

文摘内容 [目的]明确陕西省茶树种质资源的遗传多样性,为茶树育种提供依据。[方法]以陕西地方和野生种质资源、陕西临近省份以及西南茶区共8个省份的118份茶树资源为材料,利用43对高质量EST-SSR引物,用PROSize 2.0软件统计扩增条带,用Powermarker V3.25分析软件计算主等位基因频率(MAF)、基因型、等位基因数(N_a)、观测杂合度(Ho)、Nei基因多样性指数(H)和多态信息含量(PIC),用MEGA 6软件进行UPGMA聚类分析,对陕西茶树资源的遗传多样性进行分析。[结果]从118份茶树材料中共检测到310个等位基因和832个基因型。主等位基因频率(MAF)、每个位点等位基因数(N_a)、扩增基因型和多态信息含量(PIC)的平均值分别为0.336 8,7.21个,19.35和0.727 2。Nei基因多样性指数(H)在0.232 3～0.911 0,平均值为0.760 0;观察到的杂合度(Ho)在0.105 7～0.991 8,平均值为0.811 2。聚类分析结果将陕西省茶树种质资源分为3大类群,同一地区的陕西茶树资源多聚在一起;对不同地区茶树资源的聚类结果表明,陕西省茶树资源聚为一支,且与湖北的茶树资源关系较近。[结论]陕西省茶树资源具有丰富的遗传多样性和相对独立的遗传背景,且与湖北省茶树资源遗传关系较近。