辣椒EST-SSRs的分布特征及在品种多样性研究中的应用

编号 zgly0001445440

文献类型 期刊论文

文献题名 辣椒EST-SSRs的分布特征及在品种多样性研究中的应用

作者 魏兵强  刘飞云  马宗桓  陈灵芝  张茹  王兰兰  侯栋 

作者单位 甘肃省农业科学院蔬菜研究所  甘肃农业大学农学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2013年02期

年份 2013 

分类号 S641.3 

关键词 辣椒  EST-SSR  分子标记  遗传多样性 

文摘内容 为开发高效实用的EST-SSRs标记,从120605条辣椒无冗余EST序列中共搜索到10179条至少含有1个SSR的EST序列,占EST总数的8.44%。高频重复类型为一核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,占EST-SSRs总数的91.63%。最常见的基元是A/T,其次是TC/GA和CT/AG。设计合成了20对EST-SSRs引物并对25份辣椒材料进行了PCR扩增,结果表明:17对引物在供试辣椒材料中能扩增出明显的条带,其中12对引物扩增出42条多态性条带,平均多态性条带为3.5条,引物的多态性信息含量介于0.21～0.95之间。利用EST-SSRs标记对供试品种的聚类分析结果与形态学、生物学分类结果基本一致,表明本研究中开发的EST-SSRs标记可用于辣椒种质资源的遗传多样性分析。