芒果(Mangiferaindica)ζ-胡萝卜素脱氢酶基因ZDS的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001577104

文献类型 期刊论文

文献题名 芒果(Mangiferaindica)ζ-胡萝卜素脱氢酶基因ZDS的克隆及生物信息学分析

作者 张梦云  高爱平  赵志常  周开兵  黄建峰  党志国  罗睿雄 

作者单位 海南大学热带农林学院  中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开发实验室  国家热带果树品种改良中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 S667.7 

关键词 芒果  类胡萝卜素  ZDS  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 以‘红玉’芒果采后96 h的果皮为材料,采用RT-PCR技术从芒果(Mangifera indica)果皮中克隆到ζ-胡萝卜素脱氢酶基因(ZDS),其c DNA全长为1 883 bp,具有1 710 bp的开放阅读框(ORF),编码569个氨基酸。对芒果ZDS蛋白的亲水/疏水性进行预测,发现芒果ZDS蛋白所含的氨基酸亲水/疏水性主要介于+2.5~-2.6之间。通过在线软件对其进行了定位预测及二级结构和三级结构进行了预测,发现ZDS定位在叶绿体中,ZDS基因编码的蛋白质有16个螺旋,13个折叠,通过系统进化树分析发现芒果中ZDS基因编码的蛋白与柚子、甜橙、蜜柑等植物的亲缘关系比较近。