SSR在黑木耳和毛木耳转录组中的分布和序列特征

编号 zgly0001479314

文献类型 期刊论文

文献题名 SSR在黑木耳和毛木耳转录组中的分布和序列特征

作者 周雁  范秀芝  陈连福  边银丙 

作者单位 华中农业大学应用真菌研究所 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2014年02期

年份 2014 

分类号 S646.6 

关键词 黑木耳  毛木耳  转录组  简单重复序列  基序 

文摘内容 以黑木耳和毛木耳转录组测序获得的转录本序列为基础,采用软件SSR Locator对两个物种中SSR的数量、分布和结构特征等方面进行分析,发现毛木耳中SSR的丰度和密度较黑木耳小。在两者的SSR中,三碱基和六碱基重复的出现最多。对含量最多的三碱基重复序列的基序进行分析表明富含GC的SSR在这两个种的转录组中占优势地位。