大垫尖翅蝗转录组分析

编号 zgly0001495760

文献类型 期刊论文

文献题名 大垫尖翅蝗转录组分析

作者 金永玲  丛斌  王丽艳  张海燕  董辉 

作者单位 沈阳农业大学植物保护学院  黑龙江八一农垦大学农学院 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2015年08期

年份 2015 

分类号 S812.6 

关键词 大垫尖翅蝗  转录组  基因注释  GO数据库  COG数据库  KEGG数据库  简单重复序列 

文摘内容 【目的】大垫尖翅蝗Epacromius coerulipes(Ivanov)是广泛分布的草原蝗虫之一,但其基因资源缺乏。为了获得大垫尖翅蝗的基因数据,对其进行了转录组测序和分析。【方法】利用Illumina公司paired-end转录组的测序技术进行从头组装。【结果】总计获得了63 033条unigenes,平均长度为772 bp,N50为1 589 bp。通过BLAST搜索,确定有25 132条(39.87%)unigenes与NCBI数据库已知的蛋白质相匹配,其中有24 841,16 490,11 558和8 013条unigenes成功注释到Nr,Swiss-Prot,GO和COG数据库中。KEGG数据库中,7 218条unigenes形成218条代谢或信息通路。其中,189条unigenes参与外源性物质或药物的代谢通路。进一步分析显示,213条unigenes被确认为可能参与外源性物质的解毒作用,29条unigenes被确定为编码杀虫剂的目标蛋白。此外,检测到5 696条简单重复序列。【结论】该转录组测序分析将为进一步研究大垫尖翅蝗的基因功能分析及杀虫剂的抗药性机制分析奠定分子基础。