4种微孢子虫的分泌蛋白的比较基因组学分析

编号 zgly0001447920

文献类型 期刊论文

文献题名 4种微孢子虫的分泌蛋白的比较基因组学分析

作者 李田  齐晓冉  陶美林  刘显林  康定荣  秦国伟  潘国庆  周泽扬 

作者单位 家蚕基因组生物学国家重点实验室西南大学  江苏科技大学  重庆师范大学 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2013年03期

年份 2013 

分类号 S884 

关键词 微孢子虫  分泌蛋白  比较基因组学  信号肽  基序 

文摘内容 微孢子虫营专性细胞内寄生,其分泌蛋白是一类重要的侵染互作因子。利用分泌蛋白预测程序EuSecPred 2.0对家蚕微孢子虫、中蜂微孢子虫、兔脑炎微孢子虫和毕氏肠道微孢子虫的分泌蛋白进行全基因组预测,分别获得了315、90、30和45个分泌蛋白。不同微孢子虫分泌蛋白的序列平均长度和氨基酸组成特征相似,信号肽和非信号肽区均以疏水性氨基酸为主;但统计所获蛋白质功能注释的分布却是大部分分泌蛋白为各种微孢子虫的特异蛋白,仅有少部分分泌蛋白为3种以上微孢子虫所共有,如几丁质脱乙酰基酶(CDA)、热激蛋白70(HSP70)、孢壁蛋白(SWP)和Ricin B-凝集素等。4种微孢子虫分泌蛋白信号肽区的基序分别为[LI]xx[IV]xAS、L[FY]x、[LI]LL[LI][GSA]L[VI][IS][CAG]和L[LF]LFLAISAGA[SA],非信号肽区域的基序分别为[LM][RK]N、L[RK][ND]、[KR][KR][KR]LP和[PG]D[LM]。研究结果有助于揭示微孢子虫的适应性进化机制,同时也为微孢子虫的侵染和与宿主互作机制的研究提供了靶标。