家蚕微孢子虫全基因组分泌蛋白的预测分析

编号 zgly0001447891

文献类型 期刊论文

文献题名 家蚕微孢子虫全基因组分泌蛋白的预测分析

作者 李田  刘显林  韩冰  齐晓冉  康定荣  秦国伟  党晓群  潘国庆  周泽扬 

作者单位 家蚕基因组生物学国家重点实验室  西南大学  重庆师范大学 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2013年02期

年份 2013 

分类号 S884 

关键词 家蚕微孢子虫  基因组  分泌蛋白  信号肽  基序 

文摘内容 分泌蛋白是一类重要的介导病原与宿主相互作用的因子。微孢子虫专性细胞内寄生的生活方式决定了分泌蛋白在其侵染、增殖、防御和调控宿主生理活动中具有重要的作用。利用真核生物分泌蛋白预测流程EuSecPred 1.0对家蚕微孢子虫全基因组的分泌蛋白基因进行预测和严格条件筛选,鉴定获得97个分泌蛋白基因,占基因组全部编码基因的1.87%。对分泌蛋白的功能和结构域进行注释分析,发现了孢壁蛋白、丝氨酸蛋白酶抑制剂(Serpin)和Ricin B-凝集素等重要侵染相关因子。氨基酸组成分析表明,家蚕微孢子虫分泌蛋白及其信号肽主要由疏水性氨基酸组成,而信号肽剪切位点主要由亲水性氨基酸组成。基序分析发现,分泌蛋白信号肽中存在保守基序T[ILV][IVL][LI][VIL][LI]LS[IV]I[AK][SA],分泌蛋白内部存在[ES]W[VLM]K和YF[FY][DG]L 2种基序。在全基因组范围对家蚕微孢子虫的分泌蛋白进行预测分析,有助于进一步研究家蚕微孢子虫致病相关的候选因子。