小麦条锈菌萌发夏孢子cDNA文库中编码分泌蛋白的序列预测

编号 zgly0001373581

文献类型 期刊论文

文献题名 小麦条锈菌萌发夏孢子cDNA文库中编码分泌蛋白的序列预测

作者 薛晓丹  屈志鹏  王晓杰  张永红  李国田  黄丽丽  康振生 

作者单位 西北农林科技大学植保学院  陕西省农业分子生物学重点实验室 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2009年02期

年份 2009 

分类号 S435.121.42 

关键词 小麦条锈菌  分泌蛋白  信号肽  预测软件 

文摘内容 【目的】植物与病原菌互作过程中,涉及许多可以与植物受体蛋白相互识别、引发植物防卫反应的病原菌激发子或其他致病因子,其中多数为分泌蛋白,深入研究分泌蛋白将有助于明确植物与病原微生物互作的分子机制。【方法】通过SignalP v3.0、TMHMM v2.0、TargetP v1.1、Protcomp v6.0 4个软件,对陕西省农业分子生物学重点实验室构建的小麦条锈菌萌发夏孢子cDNA文库中854条EST序列进行分泌蛋白预测。【结果】得到具有可溶性分泌信号肽的蛋白编码序列33条,占测定序列的3.86%,其中最小长度为196 bp,最大为1 096 bp,分泌信号肽切割位点基本位于15~42个氨基酸,平均为37个氨基酸。【结论】预测得到的分泌蛋白编码序列,可以作为小麦与条锈菌互作过程中的激发子和致病因子备选基因来进一步研究。