香蕉枯萎病菌1号小种分泌蛋白与效应子的预测与分析

编号 zgly0001704127

文献类型 期刊论文

文献题名 香蕉枯萎病菌1号小种分泌蛋白与效应子的预测与分析

作者 何艳秋  颜瑞  蒙姑  杨文静  王振中  李云锋  聂燕芳 

作者单位 华南农业大学广东省微生物信号与作物病害重点实验室  华南农业大学农学院  华南农业大学材料与能源学院 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2020年02期

年份 2020 

分类号 S436.68 

关键词 香蕉枯萎病菌1号小种  生物信息学  分泌蛋白  效应子  碳水化合物酶类 

文摘内容 由尖孢镰刀菌古巴专化型1号小种(Fusarium oxysporum f. sp.cubense race 1,Foc1)引起的香蕉枯萎病是香蕉生产上的毁灭性病害之一。分泌蛋白作为一类重要致病因子,在Foc1与香蕉互作过程中起着重要作用。本文利用SignalP、WoLF PSORT、TargetP、TMHMM和big-PI Predictor等生物信息学软件,对Foc1全基因组编码的15 438条蛋白质氨基酸序列进行了分泌蛋白及效应子的预测分析。结果表明,Foc1全基因组编码蛋白中有988个经典分泌蛋白,占编码蛋白总数的6.40%。蛋白特征分析表明,其氨基酸长度主要集中在101～500个氨基酸(占总数的71.26%),信号肽长度集中在17～20个氨基酸(占61.94%),信号肽切割位点以SPaseⅠ型为主(占92.91%)。碳水化合物酶类(CAZymes)分析表明,有281个分泌蛋白属于CAZymes,其中以糖苷水解酶家族最多。对细胞壁降解酶类分析表明,有27个分泌蛋白属于纤维素降解酶类,73个属于果胶降解酶类,42个属于木聚糖降解酶类。以氨基酸长度≤400和半胱氨酸残基数≥4为筛选条件,发现Foc1经典分泌蛋白中有378个候选效应子。qRT-PCR分析表明,7个候选效应子均在香蕉组织提取物诱导后获得上调表达,从实验角度证实了其为真正的效应子。