苦楝丛枝植原体质粒的测定与分子特征

编号 zgly0000763001

文献类型 期刊论文

文献题名 苦楝丛枝植原体质粒的测定与分子特征

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 宋传生  林彩丽  田国忠  赵文军  朱水芳  牟海青  胡佳续  王曦茁  郭民伟 

作者单位 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所  中国检验检疫科学研究院动植物检疫研究所 

母体文献 微生物学报 

年卷期 2011,51(9)

页码 1158-1167

年份 2011 

分类号 Q939 

关键词 苦楝丛枝植原体  质粒  序列分析  系统进化  DNA杂交 

文摘内容 【目的】测定苦楝丛枝植原体(CWB植原体)质粒并分析其分子特征。【方法】扩增苦楝丛枝植原体质粒片段并进行系统进化分析,预测质粒编码蛋白的跨膜区、亚细胞定位;以质粒pCWBFq repA为模板制备探针,利用Southern blot方法检测苦楝丛枝植原体及其他几种植原体的质粒。【结果】测定了苦楝丛枝植原体福清株系的一个质粒pCWBFq,该质粒全长4446 bp,A+T含量为73.5%,编码6个蛋白,其中pCWBFq P2-P5五个编码蛋白分别含有3、2、1和2个跨膜区,其信号肽(Singnal Peptide,SP)信号值分别为0.989、0.505、0.918和0.914。氨基酸序列相似性比较表明: pCWBFq RepA蛋白与其他植原体质粒RepA的同源性在9.6%-85.6%之间,而pCWBFq SSB蛋白与其他植原体质粒SSB的同源性在74.0%-89.4%之间。用pCWBFq repA探针检测到苦楝丛枝植原体中质粒的存在,同时也能够检测到16SrI组的泡桐丛枝植原体(PaWBNy),海南长春花绿变植原体(PeVHn),苦楝丛枝植原体福州株系(CWBFz)和桑树萎缩植原体濮阳株系(MDPy)中的质粒,但16SrV组的枣疯植原体北京株系(JWBBj)、樱桃致死黄化西昌株系(CLYXc)和重阳木丛枝南昌株系(BiWBNc)中未能检测到任何杂交信号。【结论】苦楝丛枝植原体质粒pCWBFq编码的6个蛋白中,除与质粒复制有关的RepA和SSB外,另外4个均为含有疏水结构的分泌蛋白或膜蛋白。植原体质粒的同源基因间存在程度不同的变异,其中repA基因在所有植原体质粒上均存在,但变异性相对较大,而ssb基因仅存在于16SrI组植原体质粒中,且变异相对较小。16SrI组的CWBFq、PaWBNy、PeVHn、CWBFz和MDPy中均存在数量和大小不同的质粒,而16SrV组的JWBBj、CLYXc和BiWBNc中或含有的质粒因与pCWBFq repA探针的同源性较低而不能被检测到。