褶纹冠蚌线粒体基因组全序列分析

编号 zgly0000706958

文献类型 期刊论文

文献题名 褶纹冠蚌线粒体基因组全序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 蒋文枰  李家乐  郑润玲  汪桂玲 

作者单位 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室  上海市高校水产养殖学E研究院 

母体文献 遗传 

年卷期 2010(2)

页码 153-162

年份 2010 

分类号 Q943 S823.2 

关键词 褶纹冠蚌  线粒体基因组  序列分析  ATP8基因  系统进化 

文摘内容 采用LA-PCR(Long amplification polymerase chain reaction)扩增方法首次获得褶纹冠蚌(Cristariaplicata)线粒体基因组全序列。分析表明: 序列全长15712bp,包括13个蛋白质基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和26个长度为2～328bp的非编码区。A、T、C、G碱基组成分别为36.54%、27.22%、23.22%、13.02%。大部分基因在L链编码,其中ND3～ND5、ND4L、COI～COIII、ATP6、ATP8、tRNAAsp和tRNAHis在H链编码。基因排列与同科的射线佩饰真珠蚌(Lampsilis ornata)一致,与三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)在COII和12SrRNA之间存在差异。13个蛋白质基因具有I(AUU、AUC)、V(GUG)、M(AUA、AUG)3种起始密码子,除ND2终止密码子为不完整的T,其余基因均为典型的UAA或UAG。22个tRNA中,除tRNAThr、tRNALys、tRNASer(UCN)、tRNAAsp、tRNAArg、tRNATyr和tRNAMet之外,其他15个tRNA都具有典型三叶草结构。与其他淡水双壳贝类一样,褶纹冠蚌具有ATP8基因,该基因可能与细胞质的渗透压平衡有关。