4种植物病害植原体病原质粒全序列测定及分子特征

编号 zgly0000817584

文献类型 期刊论文

文献题名 4种植物病害植原体病原质粒全序列测定及分子特征

学科分类 220.3010;森林病理学

作者 胡佳续  宋传生  林彩丽  耿显胜  田国忠 

作者单位 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2013(4)

页码 90-97

年份 2013 

分类号 S763.11 

关键词 植原体  质粒  序列分析  系统进化分析 

文摘内容 根据已发表植原体质粒序列设计引物,经2次PCR扩增,获得大小不同的2段DNA片段,测序后拼接得到4种完整的环状质粒,分别是桑树萎缩植原体濮阳株系质粒(pMDPy)、长春花绿变植原体海南株系质粒(pPeVHn)、泡桐丛枝植原体山东株系质粒(pPaWBG33D)及苦楝丛枝植原体福清株系质粒(pCWBFq-2),其中pMDPy为首次测定,其质粒全长分别为3833,3943,3843和3913bp,4种质粒皆编码5种蛋白,ORF1和ORF5分别编码复制相关蛋白(RepA)和单链DNA结合蛋白(SSB),ORF2—4编码未知功能蛋白。4种质粒序列的非编码区分析表明,ORF1和ORF2之间的非编码区存在启动子和核糖体结合位点。将4种植原体质粒全序列与GenBank中登录的植原体质粒进行序列相似性比对和系统进化分析,结果表明这4种质粒与其他16SrⅠ组的质粒聚为一个大的分支,与16SrDNA系统发育树基本一致。这可为进一步深入了解不同植原体质粒的结构与功能、寄主专化性和质粒基因变异及进化奠定基础,也可为基于多基因分类鉴定提供新的理论依据。