越橘叶片转录组SSR发掘及其多态性研究

编号 zgly0001638756

文献类型 期刊论文

文献题名 越橘叶片转录组SSR发掘及其多态性研究

作者 方茜  张园园  杨钰婷  黄苗苗  符巧丽  周慧莎  陈文荣  宗宇  郭卫东 

作者单位 浙江省特色经济植物生物技术研究重点实验室浙江师范大学化学与生命科学学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年07期

年份 2018 

分类号 S663.9 

关键词 越橘  转录组  SSR  亲缘关系  多态性 

文摘内容 对高丛越橘品种‘布里吉塔’叶片转录组序列进行了简单重复序列(SSR)位点搜索和分析,发现了22 058个SSR位点,总发生频率为21.32%。SSR重复类型以二核苷酸发生频率最高(77.70%),三核苷酸次之(21.45%)。选用53对SSR引物在8个越橘属植物中进行PCR扩增,筛选出15对条带清晰且能稳定扩增的SSR核心引物。使用核心引物对39份越橘属种质进行分析,有效等位基因数最大值为7.11(Vc SSR19),最小值为1.41(Vc SSR41),平均值为3.90。香农多样性指数变化范围是0.64~2.31,平均值为1.55。观察杂合度和期望杂合度的变化范围分别是0.050~0.900和0.293~0.870,平均值分别为0.457和0.677。使用5对引物可以完全区分39份种质中的38份。南高丛越橘品种‘莱格西’和‘蓝雨’与蔓越橘品种、越橘属野生种具有更近的亲缘关系,是与野生种进行杂交育种的合适种质。