丹参病程相关蛋白基因(SmPR-10)的生物信息学及表达模式分析

编号 zgly0000769833

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参病程相关蛋白基因(SmPR-10)的生物信息学及表达模式分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 生华  刘梅  化文平  王喆之 

作者单位 教育部药用植物资源与天然药物化学重点实验室 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2011,29(3)

页码 340-346

年份 2011 

分类号 Q945.7 

关键词 SmPR-10  生物信息学分析  表达模式 

文摘内容 对丹参EST序列进行Blast分析,获得了一条病程相关蛋白10(Pathogenesis-related protein10,PR-10)基因,命名为: SmPR-10(GenBank注册号: HM439764)。分别从cDNA和gDNA水平克隆得到该基因,其序列无内含子,包含一个长为486bp的完整开放读码框,编码161个氨基酸残基。生物信息学分析显示,SmPR-10所编码的蛋白SmPR-10具有Betv1结构域,属于病程相关蛋白10家族,其相对分子量为17·47kD,为稳定的酸蛋白;无信号肽、膜锚定或跨膜结构域,为亲水性蛋白。实时定量PCR结果分析表明,SmPR-10基因主要在丹参茎中表达,其表达受到病原菌和茉莉酸甲酯逆境信号的诱导,显示SmPR-10基因可能在植物防御反应中发挥作用。