尾叶桉GLU4无性系肉桂酰乙醇脱氢酶基因克隆及序列分析

编号 zgly0001462580

文献类型 期刊论文

文献题名 尾叶桉GLU4无性系肉桂酰乙醇脱氢酶基因克隆及序列分析

作者 陈博雯  蒋华  覃鹏飞  姜伟 

作者单位 广西优良用材林资源培育重点实验室  广西林业科学研究院  广西国有维都林场  广西国有大桂山林场  广西大学生命科学与技术学院 

母体文献 西部林业科学 

年卷期 2014年02期

年份 2014 

分类号 S792.39 

关键词 尾叶桉  肉桂酰乙醇脱氢酶  木质素合成  基因克隆  序列  生物信息学分析 

文摘内容 根据植物中CAD基因保守序列设计引物,以尾叶桉GLU4嫩茎为材料克隆到其CAD基因,命名为EuCAD。序列分析结果表明,该基因gDNA长2 200 bp,cDNA长1 102 bp,开放阅读区编码356个氨基酸。EuCAD编码的蛋白质序列分析显示,序列中具有完整CAD1保守结构域,并包含NADP结合位点以及2个Zn结合位点。同源性分析结果显示,EuCAD核酸序列与其他5种桉属植物CAD基因同源性达到97%以上,EuCAD编码蛋白与碧桃等植物中CAD蛋白同源性也在79%以上。对EuCAD编码蛋白进行理化性质及结构的生物信息学分析结果显示,该蛋白为一种无信号肽、无跨膜区的酸性蛋白质,二级结构包含典型的α-螺旋和β-折叠,三级结构同源建模显示与拟南芥的AtCAD4同源性极高。系统进化树分析结果显示,该蛋白与桉属、杨属植物亲缘关系较近,与杉科植物较远。