不同品种紫花苜蓿转录组分析及营养品质差异的探讨

编号 zgly0001683895

文献类型 期刊论文

文献题名 不同品种紫花苜蓿转录组分析及营养品质差异的探讨

作者 成启明  格根图  撒多文  王志军  范文强  卜振鲲  司强  李俊峰  卢娟  贾玉山 

作者单位 内蒙古农业大学草原与资源环境学院农业部饲草栽培加工与高效利用重点试验室草地资源教育部重点实验室  内蒙古自治区科技信息研究院  内蒙古自治区草原勘察规划院  内蒙古自治区农牧业科学院  四川省会东县农牧局 

母体文献 草业学报 

年卷期 2019年10期

年份 2019 

分类号 S541.9 

关键词 紫花苜蓿  转录组测序  营养品质  denovo组装  差异基因 

文摘内容 为了丰富紫花苜蓿转录组数据信息,找出不同品种紫花苜蓿的差异基因及代谢通路。通过Illumina HiSeq 4000平台对准格尔和WL319HQ的苜蓿叶片的RNA文库进行de novo组装。得到了约39G总的核苷酸,2亿多个reads,组装得到66734个Unigenes,平均长度为869 bp。将所得到的Unigenes与NCBI nonredundant protein(Nr),A manually annotated and reviewed protein sequence database(Swissprot),Clusters of eukaryotic orthologous groups(KOG)和Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)数据库比对,分别获得44888(67.26%),29190(43.74%),24844(37.23%)和15647(23.45%)条序列的注释信息。在2个紫花苜蓿叶片中找到1098个差异表达基因(DEGs),其中有706个上调,392个下调(准格尔-vs-WL319HQ)。对其差异基因做了Gene ontology(GO)功能分析和KEGG途径分析,初步分析了2个品种营养品质差异的内在原因。极大地丰富了紫花苜蓿转录组数据信息,为今后紫花苜蓿的转录组测序提供理论依据,同时为紫花苜蓿生产实践提供参考。