香蕉Aux/IAA基因家族的全基因组鉴定及表达分析

编号 zgly0001682207

文献类型 期刊论文

文献题名 香蕉Aux/IAA基因家族的全基因组鉴定及表达分析

作者 孙雪丽  刘范  田娜  项蕾蕾  郝向阳  王云  彭丽云  王天池  程春振  赖钟雄 

作者单位 福建农林大学园艺学院园艺植物生物工程研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年10期

年份 2019 

分类号 S668.1 

关键词 香蕉  Aux/IAA基因家族  生物信息学  基因表达 

文摘内容 对香蕉Aux/IAA基因家族进行了全基因组鉴定,获得分布于除1号染色体外的10条染色体上的44个家族成员,其CDS长度为378～1 062 bp,其中10个存在选择性剪切体。它们编码的蛋白包含125～353个氨基酸,均为不含信号肽的亲水蛋白。序列分析结果表明:该基因家族成员多为5个外显子和4个内含子的基因结构,编码蛋白多具有4个典型的保守基序。亚细胞定位预测结果显示,Aux/IAA成员多定位于细胞核、细胞质和叶绿体,定位情况与保守结构域有一定相关性。MaIAA31是该家族中唯一预测有跨膜区域且亚细胞观察定位在胞外的成员。进化树分析结果显示,香蕉Aux/IAA可分为2大类8个亚组。顺式作用元件分析结果显示该家族成员启动子包含激素、光、非生物以及生物胁迫响应相关元件。通过分析部分成员在不同激素和逆境处理下的表达情况发现:MaIAA基因的表达受多因素调控,其中MaIAA27变化显著,MaIAA15响应干旱和盐胁迫,MaIAA25在热、低温和机械损伤胁迫下显著上调,暗示它们在香蕉响应这些逆境的过程中发挥作用。