苹果WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族基因的鉴定与分析

编号 zgly0001674366

文献类型 期刊论文

文献题名 苹果WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族基因的鉴定与分析

作者 王楚堃  韩朋良  王咏梅  王鹏飞  胡大刚 

作者单位 山东农业大学园艺科学与工程学院作物生物学国家重点实验室农业部黄淮地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室  山东省葡萄研究院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年06期

年份 2019 

分类号 S661.1 

关键词 苹果  WOX家族  生物信息学  基因表达 

文摘内容 利用生物信息学方法和苹果基因组数据库,鉴定并分析了12个苹果WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族基因。系统进化树分析表明,苹果WOX家族和拟南芥WOX家族可被分为现代分支(WUS分支)、中间分支和祖先分支;苹果WOX家族成员均含有1个motif-1,不同分支的成员含有其分支特异的motif;基因结构分析显示,苹果WOX家族基因含有2～4个外显子,染色体定位发现11个基因分别定位在苹果的7条染色体上,1个基因无准确定位。基因表达模式分析表明,12个基因在苹果各组织中均有表达,且在果实中的表达量较高;密码子偏好性分析显示,苹果WOX家族基因的偏好性较弱。