野生卵穗苔草泛素结合酶基因片段的克隆与序列分析

编号 zgly0001422823

文献类型 期刊论文

文献题名 野生卵穗苔草泛素结合酶基因片段的克隆与序列分析

作者 刘亚玲  杨红艳  张林  王召明  云锦凤  崔海鹏  苑峰 

作者单位 内蒙古和信园蒙草抗旱绿化股份有限公司  内蒙古农业大学生态环境学院 

母体文献 草地学报 

年卷期 2012年04期

年份 2012 

分类号 S688.4 

关键词 卵穗苔草  泛素结合酶  基因  克隆  生物信息学 

文摘内容 苔草(CarexL.)是我国极具研究开发潜力的乡土草坪草种质资源。采自内蒙古大青山的卵穗苔草(Carexduriuscula)具有较强的抗旱性和耐贫瘠力,是草坪草抗性育种的重要基因源之一。本研究从野生卵穗苔草干旱抑制性消减杂交的cDNA文库中测序获得一条长度为291bp、编码50个氨基酸的cDNA基因片段,对该基因片段进行序列分析,确定其属于泛素结合酶(ubiquitin-conjugating enzyme,E2s)蛋白家族,命名为Cd-UBC2。该基因生物信息学分析结果表明:氨基酸组成中不含吡咯赖氨酸(Ply)和硒半胱氨酸(Sec),这与其他物种UBC蛋白成分非常接近。二级结构预测表明该蛋白主要由α螺旋和无规则卷曲组成,约占92%。从野生卵穗苔草中成功获得了泛素结合酶基因片段,为克隆野生卵穗苔草泛素结合酶基因全长及最终分离、克隆苔草抗性基因,草坪草遗传改良和新品种选育奠定了基础。