普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析

编号 zgly0000817678

文献类型 期刊论文

文献题名 普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 林萍  姚小华  曹永庆  龙伟  王开良  滕建华 

作者单位 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2013(6)

页码 744-751

年份 2013 

分类号 S718.46 

关键词 普通油茶  泛素结合酶  Solexa测序  生物信息学 

文摘内容 泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一, 在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。采用Sdexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列, 命名为UBE2一J2, 该基因编码239AA, 与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性; 同源建模的结果表明: 普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点(UBCc), 第8～122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域, 第75～122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基, 其中, 87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点, 另有5个残基是与E3酶相互作用的位点。UBE2.J2具有C端延伸结构, 故普通油茶UBE2-J2蛋白属于II类E2基因家族成员。