猪CHPT1基因的发现及其表达谱分析

编号 zgly0000807453

文献类型 期刊论文

文献题名 猪CHPT1基因的发现及其表达谱分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 蒲蕾  程佳  张晓霄  杨公社  孙世铎 

作者单位 西北农林科技大学动物科技学院 

母体文献 西北农林科技大学学报: 自然科学版 

年卷期 2012(3)

页码 1-6

年份 2012 

分类号 S828 Q786 

关键词 CHPT1  Solexa测序  新转录本  猪  表达谱 

文摘内容 【目的】:对猪脂肪组织RNA的Solexa测序结果进行分析整理, 发现猪新转录本CHPTl基因。研究CHPTl在猪不同组织及脂肪细胞不同分化阶段的表达谱, 以便为后续的基因功能研究奠定基础。【方法】:取猪的背部脂肪组织提取RNA, 建立cDNA文库, 进行Solexa测序, 对测序结果进行生物信息学分析。利用反转录聚合酶链式反应(RTPCR)及实时荧光定量PCR, 克隆猪CHPTl基因的CDs区部分序列, 并对其在不同组织及脂肪细胞不同分化阶段的表达谱进行分析。【结果】:由Solexa测序分析结果发现, 猪存在新转录本基因CHPT1, 其对应的Tag表达量在180日龄大白猪与240日龄荣昌猪的脂肪组织中无明显差异, 在3日龄与240日龄荣昌猪脂肪组织中表达差异达到20倍以上。克隆获得了其CDs区193bp的cDNA序列。实时荧光定量PCR检测结果表明, CHPT1基因在3日龄和180日龄大白猪的各个组织中均有表达, 其中在肝脏和肾脏中表达量较高, 且表达量有差异。3日龄与180日龄大白猪相比, 肾脏和脂肪组织中CHPT1的表达量均有显著差异。在猪前体脂肪细胞的时序表达结果中, CHPT1表达量呈先增加后降低的趋势, 其中第2天表达量明显升高, 于第6天达到最大值, 之后降低。【结论】:猪存在CHPT1基因, 其在猪的各个组织中都有表达, 对猪的脂肪沉积可能发挥着重要作用。