柞蚕核型多角体病毒基因组编码VmiRNA的预测与功能分析

编号 zgly0001447894

文献类型 期刊论文

文献题名 柞蚕核型多角体病毒基因组编码VmiRNA的预测与功能分析

作者 李文利  林澜  王乃红  栾雨时 

作者单位 大连理工大学生命科学与技术学院  沈阳药科大学生命科学与生物制药学院  山西省蚕业科学研究院 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2013年02期

年份 2013 

分类号 S885.1 

关键词 柞蚕核型多角体病毒  Solexa测序  VmiRNA  靶基因 

文摘内容 柞蚕核型多角体病毒(ApNPV)是危害柞蚕的主要病原物之一。病毒microRNAs(VmiRNA)是由病毒基因组编码的小RNA分子,在病毒繁殖及与宿主的相互作用中发挥作用。采用高通量测序Solexa技术测定ApNPV感染柞蚕后的VmiRNA,并通过vMir软件预测ApNPV基因组可能编码的VmiRNA前体序列。在预测得到的16条前体序列中,有13条能够从病毒感染的柞蚕蛹脂肪体中扩增出条带,并有10条能在病毒基因组中找到同源序列。在ApNPV MicroRNA Solexa测序数据库中搜索到与这10条前体VmiRNAs相匹配的序列,用RT-PCR方法证明有9条能扩增出大小相应的片段,确定其为病毒基因组编码的VmiRNA的成熟序列。利用靶基因在线预测程序RNAhybrid预测到这些VmiRNA作用的135个可能的靶基因,其中有与免疫应答过程相关的基因36个,与免疫系统进程相关的基因19个,与免疫调节相关的基因8个,与免疫系统发育相关的基因9个。推测这些ApNPV基因组编码的VmiRNA在病毒与宿主之间的相互作用中扮演重要角色。