西瓜类甜蛋白家族全基因组鉴定及表达

编号 zgly0001733423

文献类型 期刊论文

文献题名 西瓜类甜蛋白家族全基因组鉴定及表达

作者 陈兵  杨钰雯 

作者单位 江苏农林职业技术学院信息工程学院 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2021,(10)

页码 1-10

年份 2021 

分类号 S651 

关键词 西瓜  类甜蛋白  生物信息学  枯萎病菌 

文摘内容 [目的]对西瓜类甜蛋白家族基因(ClTLP)进行全基因组鉴定和序列特征及聚类分析,研究其在西瓜不同组织及病原菌胁迫下的表达模式,为进一步开展类甜蛋白家族基因的功能鉴定及其与枯萎病菌互作机制研究奠定基础。[方法]利用生物学软件对ClTLP进行序列特征及聚类分析,采用qRT-PCR技术检测ClTLP基因在西瓜根、茎、叶组织及枯萎病菌侵染不同时间(0,12,24,48,120,168 h)后的表达情况。[结果]从西瓜基因组中共鉴定到28个西瓜TLP家族基因,TLP基因分布在8条染色体上,主要有4种结构类型,蛋白保守,氨基酸基序高度一致。在基因启动子区发现多个激素响应元件和胁迫响应元件。西瓜类甜蛋白归属10个聚类群。多数ClTLP基因在西瓜不同组织中表现为组成型表达,在根中的表达量高于茎和叶片。枯萎病菌侵染可以诱导大部分ClTLP基因的表达,且多数基因表达量在侵染后120 h最高。其中,Cla97C01G019790和Cla97C10G185250的表达随枯萎病菌侵染时间延长逐渐升高,而Cla97C10G204510和Cla97C10G185260的表达受到了枯萎病菌胁迫抑制。[结论]西瓜类甜蛋白家族有28个成员,其大多数CITLP基因的表达量在根中最高,可受枯萎病菌诱导,在西瓜抵御病原菌侵染过程中发挥重要作用。