编号
zgly0001496216
文献类型
期刊论文
文献题名
引进陆地棉种质材料的遗传多样性、群体结构与连锁不平衡
作者单位
新疆农业科学院核技术生物技术研究所
新疆农业科学院经济作物研究所
母体文献
分子植物育种
年卷期
2015年06期
年份
2015
分类号
S562
关键词
陆地棉
SSR
遗传多样性
群体结构
连锁不平衡
文摘内容
本研究利用121个分布于棉花全基因组的SSR标记,对187份国外棉花种质材料和31份新疆本地棉花品种进行遗传多样性、群体遗传结构和连锁不平衡分析。结果表明:218份材料共检测到284个SSR等位变异,等位基因变异数在2~9之间,遗传多样性指数平均为0.402,PIC值平均为0.355。基于STRUCTURE分析,218份材料可被划分为三个亚群(POP-1/2/3)。AMOVA分析表明,14.6%的变异来源于亚群间,85.4%的变异来源于亚群内。连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析显示,r2≥0.05(p<0.01)的条件下,10.18%的SSR位点组合存在显著的LD,整体LD水平不高,共线性位点间存在LD的比例高于非共线性位点,表明位点间的连锁对LD有重要影响。在r2=0.1时(p<0.05),LD最大遗传距离为34.7 c M,当r2=0.2时,LD最大遗传距离为9 c M。进一步对Chr.3、Chr.11、Chr.23和Chr.24共4个染色体的LD衰减距离进行分析,发现Chr.3和Chr.11具有较高的LD衰减距离。LD分析结果表明本研究群体可用于标记——性状关联分析,并且对单个染色体LD的评估将提供重要的参考。