东北粳稻群体结构和连锁不平衡分析

编号 zgly0001460091

文献类型 期刊论文

文献题名 东北粳稻群体结构和连锁不平衡分析

作者 刘化龙  郑洪亮  赵宏伟  王敬国  孙健  刘涛  张艳梅  邹德堂 

作者单位 东北农业大学水稻研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2013年05期

年份 2013 

分类号 S511.22 

关键词 粳稻  种质资源  群体结构  连锁不平衡 

文摘内容 为了利用关联分析发掘与重要农艺性状相关的数量性状基因位点,本研究采用全基因组扫描的方法,利用分布在基因组上的60对SSR引物,对140份东北三省水稻种质资源进行群体结构和连锁不平衡分析。结果表明:本研究中东北粳稻可分为2个类群,线性和非线性组合中,都有一定的连锁不平衡存在。群体中,19.2%的标记位点可以观察到显著的LD(P<0.05),其中第一类群和第二类群基于D’统计概率(P<0.05)支持的LD成对位点比例分别为2.1%和16.6%。第2类群连锁不平衡衰减(D’<0.5)所延伸的遗传距离变幅为0.32-120.4 cM,回归方程为:y=-0.0276ln(x)+0.3994。