基于SSR标记的板栗地方品种遗传多样性与关联分析

编号 zgly0001493702

文献类型 期刊论文

文献题名 基于SSR标记的板栗地方品种遗传多样性与关联分析

作者 江锡兵  汤丹  龚榜初  赖俊声 

作者单位 中国林业科学研究院亚热带林业研究所浙江省林木育种技术研究重点实验室  庆元县林业局 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2015年12期

年份 2015 

分类号 S664.2 

关键词 板栗  SSR  遗传多样性  群体结构  关联分析 

文摘内容 采用SSR标记对山东等10个省份95个板栗地方品种的遗传多样性、群体结构进行分析,并进行板栗18个农艺性状与SSR标记关联分析。结果表明:(1)17对SSR引物在95个板栗品种中检测出44个等位位点,平均为2.6个,Shannon’s指数(I)和多态性信息含量(PIC)平均值分别为0.67和0.352,遗传多样性较为丰富;(2)山东群体和江苏群体的多态性位点比率(P)最高,均达到94.12%,观察等位基因数(Na)分别为2.53和2.18,亦高于其他群体;(3)根据Evanno等统计模型,92个板栗品种被划分为3个亚群,分别包含25、40和27个品种,且均有着复杂的地理起源,另有3个品种没有明确的类群归属;(4)利用GLM和MLM模型进行关联分析,并经过假阳性检验,发现叶柄长度和淀粉含量分别与标记Cs CAT 5和Cs CAT 22显著关联,关联系数分别为0.4027和0.1869。