利用RNA-seq技术分析棘腹蛙编码区微卫星特征

编号 zgly0001006908

文献类型 期刊论文

文献题名 利用RNA-seq技术分析棘腹蛙编码区微卫星特征

作者 姜玉松  樊汶樵  徐敬明 

作者单位 重庆文理学院林学与生命科学学院  重庆珍稀濒危水产资源保护与开发研究中心 

母体文献 四川动物 

年卷期 2016(1)

页码 24-30

年份 2016 

关键词 高通量测序  棘腹蛙  微卫星 

文摘内容 棘腹蛙Paa boulengeri的遗传研究和基因组信息比较匮乏,致使可有效利用的分子标记非常有限。以棘腹蛙RNA-seq高通量测序数据为基础进行微卫星分子标记的大规模发掘和特征分析,结果显示:在121.6 Mb的棘腹蛙转录组序列中发现微卫星位点3165个,包含于3034条Contig序列中。在筛选到的1~6碱基重复核心的微卫星中,单碱基重复核心的比例最高,之后为三碱基、二碱基、四碱基、六碱基和五碱基重复核心,分别占29.0%、25.2%、21.7%、10.0%、10.0%和3.0%。