利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征

编号 zgly0000955706

文献类型 期刊论文

文献题名 利用高通量测序分析青藏高原地区青杨的SSR和SNP特征

作者 雷淑芸  张发起  Khan Gulzar  王久利  刘海瑞  陈世龙 

作者单位 中国科学院高原生物适应与进化重点实验室  中国科学院西北高原生物研究所  中国科学院大学  西南大学生命科学学院 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2015(1)

页码 37-43

年份 2015 

关键词 青杨  青藏高原  高通量测序  微卫星  单核苷酸多态性 

文摘内容 利用Illumina Hi SeqTM2000平台对采自青海玉树的青杨进行高通量测序,SSR分析共获得7 067条SSR序列,复合型SSR共525条,发生频率0.149,平均跨度4 531.87 bp。SSR重复类型中,单核苷酸重复类型最多(33.96%);三核苷酸重复类型次之(31.00%);二核苷酸重复类型位居第三(27.69%);四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸重复类型SSR含量很少(<8%)。