实时荧光定量PCR分析中毛果杨内参基因的筛选和验证

编号 zgly0001461359

文献类型 期刊论文

文献题名 实时荧光定量PCR分析中毛果杨内参基因的筛选和验证

作者 苏晓娟  樊保国  袁丽钗  崔秀娜  卢善发 

作者单位 山西师范大学生命科学学院  中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 

母体文献 植物学报 

年卷期 2013年05期

年份 2013 

分类号 S792.11 

关键词 NAC基因  毛果杨  实时定量PCR  内参基因  锌胁迫 

文摘内容 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术具有高灵敏性、高保真性和高特异性,被广泛应用于基因表达的分析。在数据处理过程中,选用稳定表达的基因作为内参基因对准确分析实验结果非常关键。以毛果杨(Populus trichocarpa)的不同组织以及锌胁迫下的组培苗为材料,使用荧光定量PCR方法分析了TUA8、TUB6、ubiquitin、GAPDH、actin、18S rRNA和EF1α7个看家基因的表达情况。通过geNorm、NormFinder和BestKeeper 3个程序的综合分析,发现actin、ubiquitin、EF1α和18S rRNA的稳定性较好,可用作毛果杨基因表达研究的内参基因;而TUB6在不同组织中稳定性最差;GAPDH在锌胁迫下的组织中稳定性最差,因此不适宜作为内参基因。毛果杨NAC基因的表达分析,进一步验证了上述结果。该研究对采用qRT-PCR方法分析毛果杨基因表达过程中内参基因的选择具有指导作用,同时对揭示NAC基因的功能也有一定的意义。