‘麦缘锦楸’叶色表型qRT-PCR内参基因筛选及验证

编号 zgly0001738276

文献类型 期刊论文

文献题名 ‘麦缘锦楸’叶色表型qRT-PCR内参基因筛选及验证

作者 杨英英  赵林姣  杨桂娟  张玉  付鹏跃  胡继文  刘莹  王楠 

作者单位 三峡大学生物技术研究中心  林木遗传育种国家重点实验室  西南林业大学林学院  东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2022,35(1)

页码 123-131

年份 2022 

分类号 S792.99 

关键词 ‘麦缘锦楸’  叶片  内参基因  QRT-PCR 

文摘内容 [目的]筛选不同叶色部位稳定表达的内参基因,为后期开展‘麦缘锦楸’叶色形成的分子机制奠定基础。[方法]以‘麦缘锦楸’不同叶色部位及灰楸对应部位叶片为材料,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测了7个候选基因(CfUBC、CfActin11、CfPP2A、CfMADH、CfGADPH、CfEF-1及CbuActin)的相对表达量,利用GeNorm、NormFinder和BestKeeper等分析软件对内参基因进行了稳定性评价。分析了‘麦缘锦楸’和灰楸不同叶色部位中萜类合成相关基因(CfGES)的表达模式,验证了上述稳定性评价结果的可靠性。[结果]7个候选内参基因在‘麦缘锦楸’和灰楸叶片中均具有作为内参基因的性能,其中,CfMADH和CfEF-1在不同叶色部位的表达量最稳定,CfGADPH和CfActin11次之,CfUBC最差。以萜类合成相关基因CfGES验证内参稳定性发现,单独或组合使用CfEF-1及CfMADH为内参基因时,CfGES的表达差异与转录组数据趋势一致。[结论]单独或组合使用CfMADH和CfEF-1来校准‘麦缘锦楸’不同叶色部位的基因表达量,可显著提高实验结果的可靠性。