灰楸CfPPR1基因的克隆及表达分析

编号 zgly0001738961

文献类型 期刊论文

文献题名 灰楸CfPPR1基因的克隆及表达分析

作者 赵林姣  杨英英  付鹏跃  张玉  费越  王楠  张大才  王军辉 

作者单位 西南林业大学林学院  林木遗传育种国家重点实验室  三峡大学生物技术研究中心  东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室 

母体文献 温带林业研究 

年卷期 2022,5(1)

页码 21-29

年份 2022 

分类号 S722.99 

关键词 ‘麦缘锦楸’  CfPPR1  克隆  基因表达 

文摘内容 【目的】挖掘调控‘麦缘锦楸’黄色边缘形成的关键基因,明确该候选基因的保守结构域、进化关系及表达特征,为下一步揭示该基因的分子生物学功能奠定基础。【方法】基于前期RNA-seq数据,筛选并克隆了与叶色相关的三角状五肽重复(pentatricopeptide repeat,CfPPR1)基因全长;利用ExPASy、InterProScan和CBS等在线工具对CfPPR1进行等电点、蛋白质结构及不同物种同源序列的进化关系和保守结构域分析;比较了CfPPR1基因在不同光照强度下的表达模式。【结果】该CDS序列全长为1902 bp,编码633个氨基酸,推测蛋白相对分子质量为71.31 kD,理论等电点(pI)为7.26;二级结构分析发现,CfPPR1序列编码的蛋白质空间结构是相对稳定的。系统进化树结果显示,CfPPR1不仅与黄化风铃木、芝麻、丹参等菊分支植物聚为一支,还与非菊分支的苹果、桃和橡胶树等具有较高的同源性,说明CfPPR1具有较高的保守性。对CfPPR1基因的表达模式分析发现,CfPPR1基因表达的上调很可能参与调控了‘麦缘锦楸’黄色边缘的形成。【结论】首次克隆得到了与叶色相关的CfPPR1基因,该基因的获得为进一步后期转基因验证CfPPR1基因功能提供有价值的参考。