曼地亚红豆杉NAC基因家族鉴定及表达分析

编号 zgly0001738524

文献类型 期刊论文

文献题名 曼地亚红豆杉NAC基因家族鉴定及表达分析

作者 张恺恺  杨立莹  丰美静  张林凤  陈段芬  邱德有  杨艳芳 

作者单位 中国林业科学研究院林业研究所  河北农业大学园艺学院  中国花卉协会 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2022,35(2)

页码 97-103

年份 2022 

分类号 S718.46 

关键词 红豆杉  NAC基因  基因鉴定  表达分析 

文摘内容 [目的]筛选红豆杉NAC转录因子家族中影响根系形成的关键基因,探索红豆杉根系生长发育分子机理。[方法]利用曼地亚红豆杉全长转录组数据,通过生物信息学方法鉴定NAC转录因子,并对筛选出的NAC转录因子进行蛋白结构及基因组织表达谱等分析。[结果]共鉴定出44个NAC转录因子,其在N端均具有典型的保守NAC结构域,分别聚类到拟南芥的7个亚家族中,蛋白三级结构较为相似,且成员大多含有5个保守亚结构域。组织表达谱显示TmNAC15、16、18、21、22、29、39、40、41和44在根中表达水平高于茎和叶。[结论]从曼地亚红豆杉中共鉴定出44个NAC转录因子,其结构较为保守,且聚类为7个亚家族,其中成员TmNAC21、22、39、40和44极有可能参与红豆杉根系生长发育。