五龄飞蝗不同发育时间实时定量PCR内参基因的筛选

编号 zgly0001478180

文献类型 期刊论文

文献题名 五龄飞蝗不同发育时间实时定量PCR内参基因的筛选

作者 崔淼  刘晓健  李涛  郭亚平  马恩波  张建珍 

作者单位 山西大学应用生物学研究所 

母体文献 应用昆虫学报 

年卷期 2014年03期

年份 2014 

分类号 S433.2 

关键词 飞蝗  实时定量PCR  内参基因  geNorm  NormFinder 

文摘内容 【目的】筛选5龄飞蝗不同发育时间的最适内参基因,为相关研究提供基础数据。【方法】本文选取β-肌动蛋白(β-actin)、延长因子(EF-1α)、3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、核糖体蛋白49(RP49)、α-微管蛋白(α-Tubulin)和18S核糖体RNA(18S rRNA)基因作为候选内参基因,运用实时定量PCR(qPCR)方法研究各基因在5龄飞蝗不同发育时间的相对表达量,用geNorm与Normfmder软件分析这6个基因表达稳定性。【结果】geNorm分析结果显示6个内参基因表达稳定度M值顺序为:β-actin(0.3720)>RP49(0.3750)>α-Tubulin(0.4030)>18S rRNA(0.4270)>EF-1α(0.4970)>GAPDH(0.6040)。M值越小表示基因表达稳定度越高,同时geNorm软件以标准化因子配对差异值(Pairwise variations)0.15默认为取舍值,由于V2/3=0.098<0.15,所以最适内参基因数目为2个。运用NormFinder软件也得出相似的结果。【结论】β-actin与RP49为5龄飞蝗不同发育时间的最适内参基因。