枸杞LbCO基因的克隆与生物信息学分析

编号 zgly0001693837

文献类型 期刊论文

文献题名 枸杞LbCO基因的克隆与生物信息学分析

作者 朱珠  李娟霞  陈健  李捷  蒋彭举  田青 

作者单位 甘肃农业大学林学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 S567.19  Q943.2 

关键词 枸杞(Lyciumbarbarum)  CONSTANS  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 CONSTANS (CO)基因是高等植物叶片中光周期途径的关键成分,生物钟及光信号控制CO基因的表达。本研究以宁夏枸杞(Lycium barbarum L.)品种之一‘宁杞7号’叶片为实验材料,通过转录组测序结果筛选,利用RT-PCR技术扩增得到‘宁杞7号’的CO基因cDNA全长序列,命名为LbCO。利用生物信息学手段对所获得的序列进行结果及功能预测,结果显示:LbCO基因的cDNA序列全长1 224 bp,编码407个氨基酸,分子质量为44.83 k D,理论等电点pI=5.58,不稳定指数为39.66,是一种稳定的非分泌蛋白。该蛋白亚细胞定位于细胞核,二级结构中无规则卷曲占比最高(54.48%),其次为α-螺旋(28.99%)。系统进化分析表明枸杞LbCO蛋白与其它物种的CO蛋白具有较高的同源性,其中与辣椒属CO蛋白亲缘关系最近。本研究为后续进一步探讨该基因编码的蛋白在调控枸杞花期研究方面提供理论参考。