丹参BTF3基因的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001373049

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参BTF3基因的克隆及生物信息学分析

作者 何苗  武雪  王喆之 

作者单位 药用植物资源与天然药物化学教育部重点实验室西北濒危药材资源开发国家工程实验室陕西师范大学生命科学学院 

母体文献 武汉植物学研究 

年卷期 2009年06期

年份 2009 

分类号 S567.53 

关键词 通用转录因子3  生物信息学  丹参 

文摘内容 采用PCR及RT-PCR技术分别从丹参基因组DNA和cDNA水平克隆了通用转录因子3(Basic TranscriptionFactor3,BTF3)基因,运用生物信息学方法对该基因编码氨基酸序列的组成成分、疏水性/亲水性、翻译后修饰、蛋白质高级结构等进行预测,利用实时荧光定量PCR检测丹参不同器官以及脱落酸和干旱诱导下BTF3的表达情况。结果表明:丹参BTF3基因全长为1510 bp,包含5个外显子和4个内含子;cDNA全长794 bp,编码蛋白整体表现为亲水性,二级结构主要由α-螺旋、不规则卷曲组成,具有NAC结构域,与其他植物的BTF3在序列组成、结构及活性位点上有高度的相似性。丹参BTF3基因在根、茎、叶中均有不同程度的表达,表达丰度为:根>茎>叶;ABA诱导该基因表达量24 h内没有显著的变化;干旱胁迫下该基因的表达受到抑制。