丹参细胞分裂素调控因子序列特征分析

编号 zgly0001651720

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参细胞分裂素调控因子序列特征分析

作者 周昌浩  林彩彩  冯园园  金花  王建华  宋振巧 

作者单位 山东农业大学农学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年11期

年份 2018 

分类号 S567.53 

关键词 丹参  细胞分裂素调控因子  生物信息学 

文摘内容 细胞分裂素通过双元信号系统感知外界环境刺激并作出应答。其中细胞分裂素响应调控因子(responseregulator,RR)是该双元信号系统中的重要构成。采用生物信息学的方法,对丹参(Salvia miltiorrhiza)细胞分裂素调控因子进行序列特征和组织表达特性分析。结果发现,丹参基因组中共有15个丹参细胞分裂素调控因子SmRR,序列比对与系统发生分析表明,SmRR1～SmRR7与拟南芥A类RR亲缘关系比较接近,划分为A类RR,SmRR8～SmRR15与拟南芥B类RR亲缘关系近,归为B类;在A类SmRR中,REC接受域含有保守的DDK残基,因此这些基因被推测有完整的功能,B类SmRR具有高度保守Myb_SHAQKYF结构域。两类SmRR的内含子、外显子组成也具有相对的保守性,顺式调控元件的分析发现,SmRR存在很多胁迫和生长调节物质的响应元件。表达量热图显示A类和B类SmRR基因分别在叶和根中表达量较高。