丹参硫氧还蛋白基因SmTrxh的克隆和生物信息学分析

编号 zgly0001373122

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参硫氧还蛋白基因SmTrxh的克隆和生物信息学分析

作者 李松丽  王喆之 

作者单位 陕西师范大学药用资源与天然药物化学教育部重点实验室  西北濒危药材资源开发国家工程实验室 

母体文献 植物生理学通讯 

年卷期 2009年05期

年份 2009 

分类号 Q943.2 

关键词 生物信息学  实时定量PCR  丹参  硫氧还蛋白 

文摘内容 对丹参EST数据库进行BLAST同源性比对发现,登录号为CV165156的EST序列与硫氧还蛋白基因(Trx)有很高的同源性。进一步用PCR方法从丹参基因组水平上克隆到长1806bp的DNA序列(登录号为FJ217699),与cDNA序列比对发现,该基因(SmTrxh)含有2个内含子。生物信息学分析表明,SmTrxh所编码蛋白的分子质量为13.4kDa,理论等电点为5.53,无信号肽,属于定位于细胞质中的稳定类蛋白。该蛋白与其他7种植物中的Trx高度同源,同源性介于68%～74%之间。实时定量PCR检测的结果显示,SmTrxh在丹参中为组成型表达基因,在根、茎和叶中都有表达,主要在根部表达,茎中的表达量最低。