丹参中硫堇基因SmTHI的克隆和表达分析

编号 zgly0001373234

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参中硫堇基因SmTHI的克隆和表达分析

作者 曹晓燕  王喆之 

作者单位 陕西师范大学药用资源与天然药物化学教育部重点实验室  西北濒危药材资源开发国家工程实验室 

母体文献 植物生理学通讯 

年卷期 2009年09期

年份 2009 

分类号 S567.53  Q943.2 

关键词 丹参  硫堇  克隆  实时定量PCR 

文摘内容 丹参EST序列的Blast分析表明,一条序列与硫堇(thionin,THI)基因有较高的同源性,该序列长575bp,包含1个长366bp的开放阅读框(ORF),编码121个氨基酸,命名为SmTHI,GenBank登陆号为DQ212984。在此基础上设计引物,分别从cDNA和gDNA水平上克隆到该基因的全编码区序列的结果表明,该基因无内含子。序列分析表明,该编码蛋白与大多数植物的THI蛋白前体高度同源,并符合植物硫堇类蛋白的序列模式和特征:C-C-X(5)-R-X(2)-[FY]-X(2)-C,N端具17个氨基酸的信号肽,中间46个氨基酸为成熟THI部分,C端的58个氨基酸为酸性多肽部分。成熟的THI蛋白带正电荷,偏碱性,推测可能有抗病原微生物活性。实时定量PCR检测SmTHI在丹参不同组织部位的表达以及在黄瓜细菌性角斑病菌(PSL)、NaCl和水杨酸(SA)溶液诱导下的表达结果表明:SmTHI在植物的根、茎和叶中均有不同程度的表达,其表达丰度为叶>茎>根;在PSL、NaCl和SA溶液诱导下该基因的表达呈上调趋势。