丹参香豆酸-3-羟化酶基因(SmC3H)的生物信息学及其组织表达模式分析

编号 zgly0000943421

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参香豆酸-3-羟化酶基因(SmC3H)的生物信息学及其组织表达模式分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 王斌  韩立敏  化文平  陈尘 

作者单位 药用资源与天然药物化学教育部重点实验室  西北濒危药材资源开发国家工程实验室  陕西师范大学  生命科学学院 

母体文献 基因组学与应用生物学 

年卷期 2015(4)

页码 813-820

年份 2015 

关键词 丹参  香豆酸-3-羟化酶  生物信息学  组织表达模式 

文摘内容 通过分析丹参转录组数据库(SRX021907)得到一条香豆酸-3-羟化酶(C3H)基因,blast比对发现该基因为丹参C3H(EU358957.1),该基因c DNA全长1 704 bp,包括1个1 503 bp的开放阅读框,编码508个氨基酸。生物信息学分析表明,其编码蛋白的分子量为57.21 k D,等电点为8.53,含琢-螺旋,延伸链和无规则卷曲,具有1个细胞色素P450蛋白(CYP450)特异的保守结构域。聚类分析表明其与芝麻的亲缘关系最近。组织特异性表达分析结果表明,该基因在茎中的表达量最丰富,其次是叶和花,根中最低。