miR-499基因家族进化分析及其对鸡骨骼肌肌纤维类型调控的研究

编号 zgly0001748436

文献类型 期刊论文

文献题名 miR-499基因家族进化分析及其对鸡骨骼肌肌纤维类型调控的研究

作者 石诗影  巨晓军  屠云洁  单艳菊  姬改革  刘一帆  章明  束婧婷 

作者单位 江苏省家禽科学研究所/江苏省家禽遗传育种重点实验室  江苏省家禽科学研究所科技创新有限公司 

母体文献 家畜生态学报 

年卷期 2022,43(12)

页码 15-22

年份 2022 

分类号 S831.2 

关键词 鸡  miR-499  分子进化  肌纤维类型 

文摘内容 为了对miR-499进行序列进化分析、靶基因预测、鉴定和表达量分析,探究其对鸡骨骼肌肌纤维类型的具体调控作用,在miRBase数据库检索miR-499基因家族的序列,利用ClustalX软件对序列特征进行分析,采用MEGA7.0构建miR-499系统发育树,再利用生物信息学工具进行靶基因预测和功能富集,最后通过荧光定量PCR和双荧光素酶报告基因试验对miR-499及其靶基因SOX6在鸡快肌和慢肌的表达量和靶向结合关系进行检测。结果发现,在43种脊椎动物中查询到75条miR-499基因家族序列,主要位于MYH7B基因内含子区,且具有较高的保守性。进化分析表明,miR-499序列进化中符合物种进化演变的规律。靶基因功能富集发现,miR-499与组织发育和能量代谢等过程有关。荧光定量检测结果显示,miR-499在鸡慢肌中表达量显著高于快肌(P《0.05),与SOX6的表达规律相反。双荧光素酶报告基因试验发现,SOX6的表达能够被miR-499-5p靶向抑制,提示miR-499可能通过SOX6基因参与肌纤维类型调控。