柳树AP2/ERF基因家族全基因组鉴定和表达分析

编号 zgly0001740400

文献类型 期刊论文

文献题名 柳树AP2/ERF基因家族全基因组鉴定和表达分析

作者 戴晓港  李淑娴 

作者单位 南京林业大学林学院 

母体文献 江苏林业科技 

年卷期 2021,48(5)

页码 1-12

年份 2021 

分类号 Q756  S792.12 

关键词 簸箕柳  AP2/ERF基因家族  分子进化  干旱胁迫  基因表达 

文摘内容 APETALA2/ethylene-responsive factor(AP2/ERF)转录因子在调控植物的生长和发育、应生物胁迫和非生物胁迫等方面扮演着至关重要的角色。该文对簸箕柳基因组中AP2/ERF基因进行查找,分析了该基因家族的保守结构域、基因结构、启动子区域顺式作用元件、基因在染色体上的分布及其在干旱胁迫下的差异表达。分析结果发现,簸箕柳中共含有208个AP2/ERF基因。根据系统发育树聚类分析的结果,这些基因可分为AP2,RAV,ERF和Soloist 4个亚类;基因结构分析表明,AP2和Soloist基因内含子较多,而多数ERF和所有RAV基因都无内含子;对启动子区域顺式作用元件分析,发现簸箕柳AP2/ERF家族基因启动子区域富含响应非生物胁迫的相关元件;对基因在染色体上分布分析表明,簸箕柳AP2/ERF基因在不同染色体上分布不均匀,其中42个基因的扩张与串联复制有关。利用蒿柳杂交子代的干旱胁迫和对照样品的转录组序列进行了差异表达分析,发现了5个AP2/ERF基因在干旱胁迫下显著上调表达。分析结果为深入研究柳树AP2/ERF基因家族的功能提供了重要参考。