枳根cDNA全长文库的构建与分析

编号 zgly0001493718

文献类型 期刊论文

文献题名 枳根cDNA全长文库的构建与分析

作者 姚利晓  王金萍  何永睿  雷天刚  许兰珍  彭爱红  邹修平  陈善春 

作者单位 西南大学柑桔研究所  国家柑桔工程技术中心  国家柑桔品种改良中心 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2015年01期

年份 2015 

分类号 S666 

关键词 枳  根  全长c DNA文库  表达序列标签  生物信息学分析 

文摘内容 为了解柑橘优良砧木枳(Poncirus trifoliata)根部的基因表达信息,利用SMART技术构建了枳的根组织全长c DNA文库。检测结果显示所建枳根原始文库的容量为1.08×106 cfu·m L-1,扩增后文库容量为1.30×109 cfu·m L-1,重组率为95%。通过文库随机测序获得182个长度大于100 bp的ESTs序列(Gen Bank登录号为JK316116~JK316297),序列拼接后得到96个Unigenes,包括12个Contigs和84个singletons。其中,68个Unigenes可与Gen Bank中登录的基因相匹配,56个与已知的柑橘基因相匹配,36个为全长基因。对24个全长基因完成了功能注释,并进一步开展了生物信息学分析,发现有6个应激反应基因和3个根发育相关基因。