8种植物CHI基因的生物信息学分析

编号 zgly0001438342

文献类型 期刊论文

文献题名 8种植物CHI基因的生物信息学分析

作者 原晓龙  周军  辛培尧  董娇  孟富宣  付海辉 

作者单位 西南林业大学林学院  西南林业大学西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点实验室  中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所  复旦大学生命科学学院 

母体文献 西南林业大学学报 

年卷期 2013年02期

年份 2013 

分类号 Q943 

关键词 查尔酮异构酶  生物信息学分析  蛋白质功能预测 

文摘内容 根据GenBank上已登录的拟南芥、苹果杂交种、草莓、桃、沙梨的栽培种美人酥、葡萄、柑橘和玉米的查尔酮异构酶基因蛋白质氨基酸残基序列,应用生物软件对其组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性与亲水性、蛋白质二级和三级结构以及功能域进行预测和分析。结果表明:8种植物的CHI不具有导肽,不存在信号肽,不具有跨膜结构,推测CHI可能定位于细胞质基质中发挥功能,多肽链总体表现为亲水性;有α-螺旋、β-转折、无规则卷曲和延伸链4种二级结构,除了无规则卷曲是桃的最主要二级元件外;其余7种植物均是α-螺旋为最主要的结构元件;8种植物可能均有1个查尔酮异构酶活性部位。