忍冬AsA-GSH途径相关基因鉴定分析及对低温的响应

编号 zgly0001723859

文献类型 期刊论文

文献题名 忍冬AsA-GSH途径相关基因鉴定分析及对低温的响应

作者 乔永刚  贺嘉欣  陈亮  贾孟君  宋芸 

作者单位 山西农业大学生命科学学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2020年11期

年份 2020 

分类号 S567.79 

关键词 忍冬  AsA-GSH  转录组  生物信息学  调控网络 

文摘内容 谷胱甘肽-抗坏血酸(ascorbate-glutathione, AsA-GSH)途径在植物抗氧化过程中具有重要作用。本研究基于忍冬转录组数据,利用生物信息学的方法对AsA-GSH途径中的LAPX、RRM、G6PD、NRT和PGD调控基因进行相关分析。结果表明:LjLAPX、LjG6PD和LjNRT为不稳定的疏水蛋白, LjRRM和LjPGD为稳定的疏水蛋白。二级结构均为混合型结构,α-螺旋作为多肽链中的大量结构元件分布于整个多肽链中。利用同源建模法分析了蛋白质的三维结构。跨膜结构预测显示LjRRM、LjG6PD和LjPGD无跨膜区, LjLAPX和LjNRT分别有2个和11个跨膜区域。KEGG分析了AsA-GSH途径的代谢调控网络。基因表达分析发现,整个低温过程中LjLAPX、LjRRM、LjG6PD、LjNRT和LjPGD基因均差异表达,共同调控GSH和AsA的水平,提高植物的抗性。RT-qPCR试验进一步证明了转录组数据的可靠性。