牡丹实时定量PCR分析中内参基因的选择

编号 zgly0000789045

文献类型 期刊论文

文献题名 牡丹实时定量PCR分析中内参基因的选择

学科分类 220.50;园林学

作者 王彦杰  董丽  张超  王晓庆 

作者单位 北京林业大学园林学院 

母体文献 农业生物技术学报 

年卷期 2012,20(5)

页码 521-528

年份 2012 

分类号 S685.11 

关键词 牡丹  实时荧光定量PCR  内参基因  geNorm  NormFinder 

文摘内容 摘要实时荧光定量PCR(qPCR)是目前研究基因定量表达的重要方法, 根据特定实验材料及条件选择qPCR分析中合适的内参基因对于准确校正目的基因的表达至关重要。本研究以牡丹(PaeoniasuffruticosaAndr.)不同组织(根、茎、叶和花瓣)、切花开放不同时期及不同处理(乙烯或葡萄糖处理)的花瓣为材料, 利用qPCR技术探讨了5种常用看家基因: 卢一微管蛋白基因够-tubulin)、泛素基因(ubiquitin)、甘油醛.3.磷酸.脱氢酶基因(GAPDH)、肌动蛋白基因(actin)及18S核糖体RNA(188rRNA)的表达情况, 各看家基因均能特异扩增并显示较高的扩增效率。经geNorm和NormFinder程序统计学计算处理, 综合分析结果显示, 在牡丹不同组织或切花开放不同时期花瓣中, ubiquitin表达最为稳定; 在不同处理的切花花瓣中, GAPDH表达最为稳定, 二者分别适宜作为相应条件下的内参基因。本研究认为, 各实验条件下使用ubiquitin和GAPDH两个表达最稳定的基因组合, 即可获得更为精确的基因表达结果。本研究结果对牡丹中关键基因的定量表达分析具有重要的实用价值。