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新城疫病毒贵州分离株F基因的克隆和序列分析



编号 zgly0001340292

文献类型 期刊论文

文献题名 新城疫病毒贵州分离株F基因的克隆和序列分析

作者 伍祥龙  温贵兰  袁翠霞  周碧君  文明  李永明 

作者单位 贵州大学动物科学学院 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2008年07期

年份 2008 

分类号 S852.6595 

关键词 新城疫病毒  F基因  克隆  序列分析 

文摘内容 根据GenBank中登录的新城疫病毒(NDV)F基因序列设计了一对引物,用RT-PCR方法扩增了8个NDV贵州分离株的F基因片段,并将其分别克隆到pMD-18T载体中。序列分析结果表明,上述分离株F基因长度为1662bp,编码553个氨基酸,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为84.0%~99.7%和87.5%~99.3%,但与LaSota、B1及F48E9等常见毒株的氨基酸同源性为87.2%~97.7%。F蛋白裂解位点的氨基酸序列分别为112R-R-Q-R/K-R-F117(其中P1、H2、N98、DQ、FW、BY、GZ7株为强毒)和112G-R-Q-G-R-L117(TN1株为弱毒)。利用MegAlign软件绘制NDV的系统发育进化树,结果表明,4个分离株(P1、H2、、N98、DQ)为基因Ⅶ型,2株(GZ、TN)为基因Ⅱ型,2株(FW、BY)为基因Ⅸ型。

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